在植物园的右侧是一个小型的动物园，这是世界上最古老的动物园之一，始建于1794年，饲养着不少珍稀的动物，包括240头哺乳动物、500只鸟类和130只爬行动物，面积为5.5公顷。最奇特的是其中还有一个显微动物园，可以在显微镜下观察在森林中和我们的房间里生活的微小动物。位于万塞娜森林的巴黎动物园是自然博物馆的一部分，那是一个真正的大型动物园，占有14.5公顷的面积，饲养了1200多只动物，中国赠送给法国的大熊猫也在这里生活，珍奇的动物还包括普氏野马、霍加狓、倭河马、狐猴、麋鹿、华北豹、雪豹、懒猴等。