树木虽寿长千年，但由于人类的活动而屡遭破坏。庄子在寓言中描述“散木”因无用而保天年，高大悠古。现实中能保存至今的名木古树多与寺庙有关。由于人们对宗教的信仰，使得寺庙周围的树木神化而免遭破坏，历代相传，蔚为壮观。如曲阜孔庙大成门内左侧有一桧挺立，高约10m,，粗可合抱，树冠如帷盖，青笼苍翠，旁有一树桩，饱经风雨而未摧，这便是驰名天下的“先师手植桧”。此桧被视为孔子思想的象征，倍受敬仰。明代钟羽正的《孔庙手植桧歌》将古桧视为孔学兴衰的象征：“此桧日茂则孔氏日兴”，并与王朝的兴衰相联系：“恍惚枯荣关气数”。孔庙中的另一景“杏坛”，其杏树不但凝固“孔子游乎缁帷之林，坐休乎杏坛之上，弟子读书，孔子弦歌鼓琴”的历史故事，而且把红花摇曳的杏树提升到：“岂是人间凡卉比，文明终在共春熙”的神化高度。再如北京孔庙大成殿前的古柏，已有600多年历史，“凌寒翠不夺，还暄绿更浓。”据民间传说，明代奸相严嵩代嘉靖皇帝来此祭孔，被柏枝掀掉了乌纱帽，严被罢相后，人们称此柏为“除奸柏”。

　　清代龚自珍《说京师翠微山》记叙了龙泉寺上之四松：“形偃神飞，白昼若雷雨;四松之蔽可千亩。”北京西山八大处香界寺山门内的古松，“雪霜知劲质，今古占嘉名”，是寺庙悠久历史的见证。北京大觉寺寺中有被誉为“大觉六绝”的奇景珍物，其中三绝是古木：植于400年前的白玉兰、抱塔松和6人方可合抱的古银杏树。